A vizsgálati idő jelentősen lecsökken, körülbelül egy óráról néhány percre az újonnan jelentett RTF-EXPAR módszerrel, amely reverz transzkriptáz-mentes (RTF) megközelítést alkalmaz a RNS bele DNS ezt követi az EXPAR (Exponential Amplification Reaction) az egyetlen hőmérsékleten történő amplifikációhoz.
Az arány szabályozása Covid-19 terjedése pontos és gyorsabb vírustesztelési stratégiát igényel. RT-PCR (reverz transzkriptáz polimeráz láncreakció), a jelenleg alkalmazott legpontosabb vizsgálati módszer egy kétlépéses teszt, amely mintánként körülbelül 60 percet vesz igénybe.
A Birminghami Egyetem kutatói egy új módszerről számoltak be a SARS-CoV-2 kimutatására. Ez sokkal gyorsabb tesztelést tesz lehetővé, és kellően érzékeny.
A vírus RNS kimutatása a RT-PCR (reverz transzkriptáz polimeráz láncreakció) magában foglalja a vírus RNS átalakítását komplementer DNS-vé (cDNS), majd a cDNS amplifikációját kvantitatív PCR-rel (qPCR). A cDNS-t ezután fluoreszcens festékkel detektáljuk. Ez legfeljebb egy órát vesz igénybe.
A vizsgálati idő jelentősen lecsökken, körülbelül egy óráról néhány percre az újonnan jelentett RTF-EXPAR módszerrel, amely reverz transzkriptáz-mentes (RTF) megközelítést alkalmaz az RNS átalakítására. DNS ezt követi az EXPAR (Exponential Amplification Reaction) az egyetlen hőmérsékleten történő amplifikációhoz. Az egyetlen hőmérsékleten végbemenő amplifikáció a gyorsaság kulcsa, mert így elkerülhető az RT-PCR hosszadalmas fűtési és hűtési lépése. Ezenkívül az amplifikált DNS-szakasz kisebb, mint az RT-PCR-hez képest. Ezért az EXPAR akár 108 szál DNS-terméket is generál néhány perc alatt. A duplex képződést az RT-PCR módszerhez hasonlóan követjük nyomon, SYBR Green fluoreszcens festékkel.
Érdekes módon az új módszer számos más RNS-vírusok által okozott fertőző betegség kimutatására is módosítható, mint például az Ebola, az RSV stb.
Forrás (ok):
Carter és munkatársai (2020). A SARS-CoV-5 RNS 2 perc alatti kimutatása reverz transzkriptáz-mentes exponenciális amplifikációs reakcióval, RTF-EXPAR. Előnyomtatás. Közzétéve: medRxiv Közzétéve: 04. január 2021. DOI: https://doi.org/10.1101/2020.12.31.20248236
***
